Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mmp3P28862 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mmp3P28862 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mmp3P28862 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mmp3P28862 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mmp3P28862 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mmp3P28862 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mmp3P28862 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mmp3P28862 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mmp3P28862 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mmp3P28862 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mmp3P28862 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Mmp3P28862 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mmp3P28862 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mmp3P28862 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms