Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col2a1P28481 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col2a1P28481 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms