Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Etv4P28322 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Etv4P28322 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms