Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa2P28309 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms