Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aco1P28271 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Aco1P28271 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms