Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gjb1P28230 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms