Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vav1P27870 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vav1P27870 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vav1P27870 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vav1P27870 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vav1P27870 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms