Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PdgfraP26618 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms