Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra3P26049 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms