Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk11bP24788 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms