Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gria1P23818 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms