Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm43693-201ENSMUST00000196072 1249 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Tac1-203ENSMUST00000184986 691 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm17042-201ENSMUST00000167075 1216 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm6236-201ENSMUST00000193785 1009 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms