Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms