Protein–RNA interactions for Protein: P23506

Pcmt1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmt1P23506 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcmt1P23506 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms