Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ggta1P23336 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms