Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PparaP23204 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PparaP23204 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PparaP23204 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PparaP23204 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PparaP23204 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PparaP23204 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PparaP23204 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PparaP23204 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PparaP23204 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PparaP23204 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PparaP23204 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PparaP23204 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PparaP23204 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PparaP23204 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PparaP23204 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PparaP23204 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PparaP23204 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PparaP23204 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PparaP23204 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PparaP23204 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PparaP23204 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PparaP23204 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PparaP23204 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PparaP23204 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PparaP23204 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PparaP23204 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PparaP23204 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PparaP23204 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PparaP23204 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PparaP23204 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PparaP23204 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PparaP23204 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms