Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RarbP22605 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RarbP22605 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RarbP22605 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RarbP22605 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RarbP22605 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RarbP22605 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RarbP22605 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RarbP22605 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RarbP22605 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RarbP22605 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RarbP22605 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RarbP22605 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RarbP22605 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RarbP22605 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RarbP22605 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RarbP22605 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RarbP22605 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms