Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnnc2P20801 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnnc2P20801 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms