Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxb9P20615 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms