Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcer1aP20489 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fcer1aP20489 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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