Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkcaP20444 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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