Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VimP20152 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VimP20152 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VimP20152 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VimP20152 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VimP20152 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VimP20152 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VimP20152 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VimP20152 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VimP20152 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VimP20152 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VimP20152 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VimP20152 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VimP20152 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VimP20152 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VimP20152 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VimP20152 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VimP20152 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VimP20152 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VimP20152 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VimP20152 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VimP20152 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VimP20152 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VimP20152 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VimP20152 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VimP20152 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
VimP20152 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VimP20152 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VimP20152 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
VimP20152 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VimP20152 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VimP20152 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms