Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms