Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P18533 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18533 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18533 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P18533 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18533 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18533 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18533 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18533 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18533 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18533 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18533 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18533 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18533 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18533 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18533 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18533 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18533 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18533 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18533 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18533 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18533 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms