Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18527 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18527 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18527 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18527 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18527 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18527 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18527 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18527 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms