Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18524 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18524 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P18524 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18524 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18524 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18524 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18524 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18524 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18524 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18524 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18524 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18524 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P18524 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P18524 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P18524 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P18524 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P18524 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18524 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18524 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18524 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18524 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18524 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18524 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18524 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P18524 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms