Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PcnaP17918 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms