Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pou4f1P17208 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pou4f1P17208 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms