Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcna1P16388 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcna1P16388 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms