Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim30aP15533 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim30aP15533 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms