Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd44P15379 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd44P15379 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd44P15379 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd44P15379 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms