Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54P14576 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp54P14576 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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