Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scd1P13516 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scd1P13516 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms