Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Vpreb2P13373 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms