Protein–RNA interactions for Protein: P13297

Msx1, Homeobox protein MSX-1, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1P13297 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx1P13297 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx1P13297 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx1P13297 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Msx1P13297 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Msx1P13297 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msx1P13297 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msx1P13297 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Msx1P13297 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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