Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrm1P12657 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms