Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DmdP11531 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DmdP11531 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DmdP11531 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DmdP11531 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DmdP11531 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DmdP11531 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DmdP11531 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DmdP11531 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DmdP11531 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DmdP11531 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DmdP11531 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DmdP11531 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DmdP11531 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DmdP11531 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DmdP11531 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
DmdP11531 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
DmdP11531 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DmdP11531 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DmdP11531 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DmdP11531 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DmdP11531 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DmdP11531 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DmdP11531 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DmdP11531 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DmdP11531 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DmdP11531 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DmdP11531 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DmdP11531 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DmdP11531 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DmdP11531 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DmdP11531 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DmdP11531 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DmdP11531 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DmdP11531 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DmdP11531 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DmdP11531 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DmdP11531 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms