Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tnp2P11378 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms