Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spp1P10923 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spp1P10923 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spp1P10923 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms