Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nid1P10493 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nid1P10493 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nid1P10493 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nid1P10493 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nid1P10493 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nid1P10493 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nid1P10493 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms