Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms