Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnmt3cP0DOY1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms