Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbk3P0C5K0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms