Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NefmP08553 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NefmP08553 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NefmP08553 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NefmP08553 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NefmP08553 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NefmP08553 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NefmP08553 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NefmP08553 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefmP08553 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefmP08553 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefmP08553 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefmP08553 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefmP08553 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefmP08553 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefmP08553 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefmP08553 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefmP08553 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefmP08553 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefmP08553 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefmP08553 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefmP08553 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefmP08553 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefmP08553 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefmP08553 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NefmP08553 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NefmP08553 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefmP08553 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefmP08553 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefmP08553 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefmP08553 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefmP08553 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NefmP08553 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefmP08553 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefmP08553 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefmP08553 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefmP08553 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefmP08553 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefmP08553 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefmP08553 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NefmP08553 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NefmP08553 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefmP08553 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefmP08553 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefmP08553 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefmP08553 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefmP08553 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefmP08553 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefmP08553 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefmP08553 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefmP08553 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefmP08553 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefmP08553 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefmP08553 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NefmP08553 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms