Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms