Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spta1P08032 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spta1P08032 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spta1P08032 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spta1P08032 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spta1P08032 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spta1P08032 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Spta1P08032 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Spta1P08032 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Spta1P08032 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spta1P08032 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spta1P08032 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spta1P08032 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spta1P08032 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spta1P08032 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spta1P08032 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spta1P08032 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spta1P08032 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spta1P08032 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spta1P08032 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Spta1P08032 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spta1P08032 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Spta1P08032 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spta1P08032 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spta1P08032 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spta1P08032 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spta1P08032 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spta1P08032 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spta1P08032 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spta1P08032 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spta1P08032 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms