Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csf1P07141 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf1P07141 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Csf1P07141 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csf1P07141 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csf1P07141 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf1P07141 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csf1P07141 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf1P07141 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf1P07141 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Csf1P07141 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csf1P07141 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Csf1P07141 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Csf1P07141 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Csf1P07141 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Csf1P07141 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf1P07141 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf1P07141 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csf1P07141 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf1P07141 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Csf1P07141 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf1P07141 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf1P07141 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf1P07141 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf1P07141 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf1P07141 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf1P07141 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Csf1P07141 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf1P07141 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csf1P07141 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms