Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06336 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06336 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06336 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06336 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06336 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06336 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06336 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06336 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06336 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06336 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms