Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgamP05555 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ItgamP05555 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ItgamP05555 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms