Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tk1P04184 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tk1P04184 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tk1P04184 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tk1P04184 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tk1P04184 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tk1P04184 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms